未设警用航空管理职能部门的公安机关，其警用无人驾驶航空器由（ ）来进行管理。

**解析：** 根据《公安机关警用无人驾驶航空器管理规定》及相关警务保障工作要求，警用无人驾驶航空器的管理遵循“统一领导、分级负责、归口管理”的原则。 1. **归口管理部门**：通常情况下，设有警用航空管理职能部门的公安机关，由该部门负责警用无人驾驶航空器的管理工作。 2. **特殊情况处理**：对于**未设**警用航空管理职能部门的公安机关，其警用无人驾驶航空器管理工作由**警务保障部门**负责。这是因为警务保障部门主要负责公安机关的装备财务、后勤保障等工作，而警用无人驾驶航空器属于警用装备的重要组成部分，因此在没有专门航管部门的情况下，由其归口管理符合职能定位。 **选项分析：** * A项 **政工监督室**：主要负责人事、思想政治工作及内部纪律监督，不涉及装备管理。 * B项 **法制室**：主要负责法律审核、执法监督及行政复议等法律事务，不负责具体装备管理。 * C项 **指挥中心**：主要负责接处警、指挥调度和情报研判，虽然可能使用无人机进行实战指挥，但通常不承担装备的行政管理和维护保养职责。 * D项 **警务保障部门**：负责警用装备的采购、配发、维护和管理，是未设专门航管部门时的法定管理主体。 故正确答案为 **D**。