使用有碍行车的小型养路机械作业应办理（　 　）手续，设置移动停车信号防护。

这是一道关于铁路施工安全手续的选择题。我们需要分析各个选项，并结合铁路施工的相关规定来确定正确答案。

首先，理解题目背景：使用有碍行车的小型养路机械作业，这种作业可能会对铁路行车造成影响，因此需要采取相应的安全措施。

接下来，分析各个选项：
A. 封锁施工：封锁施工意味着在一定时间内，某段铁路将暂停行车，以便进行特定的施工或维护作业。这适用于可能对行车安全造成较大影响的情况，与题目中“有碍行车”的描述相符。

B. 慢行施工：慢行施工通常指的是在施工期间，列车需要降低速度通过施工区域。然而，对于有碍行车的小型养路机械作业，仅仅降低速度可能不足以确保安全，因此这个选项可能不够充分。

C. 临时封锁施工：虽然这个选项也涉及到封锁，但“临时”一词可能意味着封锁的时间和条件具有不确定性，不够明确和严格，可能不足以应对有碍行车的作业。

D. 车站承认手续：这个选项更偏向于一种行政或程序上的手续，而不直接关联到施工对行车安全的影响。它可能不足以作为确保施工安全的主要措施。

综上所述，考虑到使用有碍行车的小型养路机械作业对铁路行车安全的潜在影响，需要采取更严格的安全措施。因此，封锁施工（选项A）是最合适的措施，因为它能确保在施工期间，相关铁路段完全停止行车，从而最大限度地减少安全风险。

因此，答案是A. 封锁施工。