机车零部件的配合面、工作面、加工面清洁度要求为()级。

解析此类题目时，首先需要理解机车零部件清洁度级别的含义。清洁度级别通常指的是零件表面残留物质（如油污、尘埃、金属屑等）的数量和程度，不同的级别对应着不同的清洁标准，以确保机械部件在组装和运行中的性能和寿命。

题目问的是机车零部件的配合面、工作面、加工面的清洁度要求。给定的选项从A到D分别是Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ级。

Ⅰ级通常是最高清洁度标准，适用于极端关键的组件或特殊环境下的应用。
Ⅱ级表示较高的清洁度，适合于重要部件，可以满足大多数精密设备的要求。
Ⅲ级是一个中等的清洁标准，适合于一般机械部件。
Ⅳ级则是较低的清洁度标准，适用于对清洁度要求不是很高的场合。

对于机车这样的机械设备而言，配合面、工作面和加工面是相对比较重要的部分，它们直接影响到机车的性能和安全性，因此需要较高的清洁度标准来保证其正常运作。但是，考虑到实际操作中的经济性和可行性，通常不会选择最高的Ⅰ级标准。

根据题意和通常的工业实践，B选项（Ⅱ级）是正确的答案，因为它既能保证机车零部件的重要表面达到足够的清洁度，又不至于过于苛刻而导致成本过高。