复合通行卡在使用中遇系统提示(),应立即停止使用,以免影响二义性路径识别效果,并迅速进行清卡、休眠处理。

这道题目考察的是对复合通行卡（通常用于高速公路等交通收费系统）在使用中遇到特定提示时应采取的措施。我们来逐一分析选项：

A. 电量低：虽然电量低可能会影响复合通行卡的正常使用，但它并不直接关联到二义性路径识别的效果。电量低更多是关乎卡片是否能持续工作，而非其数据准确性或路径识别能力。因此，这不是影响二义性路径识别效果的关键因素。

B. 破损：卡片破损确实可能影响其整体功能，包括数据存储和传输。然而，这种影响更偏向于物理损坏导致的功能丧失，而非直接针对二义性路径识别的特定问题。此外，题目强调的是“系统提示”，而破损通常不会由系统直接提示，而是由人工检查发现。

C. 错误或警告：这个选项直接关联到系统对复合通行卡状态的监测和反馈。如果系统提示“错误或警告”，这很可能意味着卡片当前的状态或存储的数据存在问题，这些问题会直接影响到二义性路径识别的效果。因此，立即停止使用并进行相应处理是合理的应对措施。

D. 非系统卡：这个选项表明卡片可能不属于当前系统所识别的范畴。然而，题目描述的是在使用中的复合通行卡遇到系统提示时应采取的措施，而“非系统卡”更可能是卡片在初次验证或插入时就被识别出来的问题，而非在使用过程中突然出现的。此外，即使是非系统卡，其是否影响二义性路径识别也需要具体情况具体分析，不如“错误或警告”那么直接和明确。

综上所述，选项C“错误或警告”最符合题目要求，因为它直接关联到系统对复合通行卡状态的实时反馈，且这种反馈会直接影响二义性路径识别的效果。因此，正确答案是C。