设计灌溉渠道时，如果糙率系数取值偏小，就会使渠道断面过大而增加工程量。

选项A：正确。这个选项表述的是糙率系数取值偏小会导致渠道断面过大的情况，但实际上这是不准确的。

选项B：错误。这个选项指出上述说法是错误的，而实际上糙率系数取值偏小的确不会导致渠道断面过大。

解析： 糙率系数是反映渠道壁面粗糙程度的一个系数，它影响水流的阻力。在设计灌溉渠道时，糙率系数的取值对渠道的断面尺寸有重要影响。如果糙率系数取值偏小，意味着渠道壁面较为光滑，水流阻力较小，因此在相同流量下，所需渠道断面可以较小，从而减少工程量。相反，如果糙率系数取值偏大，会导致计算出的渠道断面过大，增加工程量。

因此，正确答案是B，因为糙率系数取值偏小不会使渠道断面过大，而是会使渠道断面变小。

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