使用小车时，（ ）应了解列车运行情况，按规定设置防护，并保证能在列车到达前撤出线路。

这是一道关于施工安全和列车运行管理的问题，我们需要分析各个选项与题目描述的关联性，以确定哪个角色最适合在特定情境下（使用小车时）了解列车运行情况，并设置相应的防护措施。

首先，理解题目背景：使用小车时，需要有人负责了解列车运行情况，确保能在列车到达前撤出线路，以避免事故。

接下来，分析各个选项：

A选项（车站值班员）：车站值班员主要负责车站的整体运营和调度，虽然了解列车运行情况，但不一定直接参与施工现场的安全管理。
B选项（驻站防护员）：驻站防护员确实负责施工安全的一部分，但更侧重于现场的直接防护工作，而非全面了解和掌握列车运行情况。
C选项（工长）：工长主要负责施工现场的组织和管理，虽然对施工安全有责任，但不一定直接负责列车运行情况的掌握。
D选项（施工负责人）：施工负责人是施工现场的全面负责人，负责施工的整体规划、组织、协调和安全管理。在使用小车等涉及列车运行安全的作业时，施工负责人需要全面了解列车运行情况，确保施工安全和效率。同时，他/她也有责任确保所有安全措施得到执行，包括在列车到达前撤出线路。

综上所述，D选项（施工负责人）最适合作为在使用小车时了解列车运行情况，并设置相应防护措施的角色。因为施工负责人负责施工的整体安全管理，需要全面掌握相关信息，以确保施工安全和效率。

因此，答案是D。