下列违反烟花爆竹安全管理规定的行为，由公安机关依法查处的有（）

这道题目考察的是对烟花爆竹安全管理规定的理解。根据相关法律法规，对选项进行如下解析：

A. 某烟花爆竹生产企业超出安全生产许可证核定的产品种类进行生产：
这种行为违反了《安全生产许可证条例》，应该由负责安全生产监督的部门处理，而不是公安机关。因此，A选项不符合题意。

B. 某从事烟花爆竹批发的企业向某从事烟花爆竹零售的经营者供应非法生产、经营的烟花爆竹：
这种情况涉及到非法生产与经营的问题，通常应该由工商行政管理部门或安全生产监督管理部门处理，不是公安机关直接查处的对象。所以，B选项也不符合题意。

C. 某生产黑火药、烟火药、引火线的企业，丢失1000米引火线未及时向当地安全生产监督管理部门和公安部门报告：
根据《烟花爆竹安全管理条例》，如果出现此类情况，企业必须及时向当地安全生产监督管理部门和公安机关报告，否则将由公安机关依法处理。因此，C选项是正确的。

D. 李某运输烟花爆竹，未随车携带《烟花爆竹道路运输许可证》：
根据《烟花爆竹安全管理条例》，运输烟花爆竹需要取得相应的运输许可，并且在运输过程中应携带相关证件备查。如果没有随车携带，则违反了规定，应当由公安机关查处。因此，D选项也是正确的。

综上所述，正确答案为CD。