水利水电工程施工的重大危险源应主要从下列几方面考虑:（）。

这道题主要考察的是水利水电工程施工中重大危险源的识别。我们来逐一分析各个选项，并解释为什么选择A、B、C、E，而不选择D。

A项：（A）石方边坡高度大于50m的高边坡作业

这个选项是合理的，因为高边坡作业存在滑坡、崩塌等严重安全风险，特别是在高度大于50m的情况下，这些风险显著增加，因此被视为重大危险源。

B项：（B）开挖深度超过3m（含）的深基坑作业

同样，深基坑作业也存在坍塌、地下水突涌等风险，特别是开挖深度超过3m时，这些风险显著增加，因此也被视为重大危险源。

C项：（C）搭设高度5m以上的混凝土模板支撑工程

模板支撑工程在搭设高度较高时，存在坍塌风险，对施工人员安全构成威胁。因此，搭设高度5m以上的混凝土模板支撑工程也被视为重大危险源。

D项：（D）隧洞开挖及衬砌支护工程

这个选项虽然涉及水利水电工程中的重要施工环节，但并非所有隧洞开挖及衬砌支护工程都自动构成重大危险源。其风险程度取决于具体的地质条件、施工方法、支护措施等多种因素。因此，不能一概而论地将其视为重大危险源。

E项：（E）搭设高度24m以上的落地式钢管脚手架工程

脚手架工程在搭设高度较高时，稳定性问题尤为突出，存在严重的坍塌风险。因此，搭设高度24m以上的落地式钢管脚手架工程也被视为重大危险源。

综上所述，A、B、C、E四项均描述了水利水电工程施工中可能构成重大危险源的施工环节或作业，而D项则因风险程度的不确定性而不被直接视为重大危险源。因此，正确答案是A、B、C、E。