农村集体经济组织的水塘和由农村集体经济组织修建管理的水库中的水，归各该农村集体经济组织所有。

解析：

本题考察的是农村集体经济组织对水资源的所有权归属问题。

选项A：“正确” - 这个选项认为农村集体经济组织对其水塘和由其修建管理的水库中的水拥有所有权。然而，根据我国《水法》的相关规定，水资源属于国家所有，即水资源的所有权由国务院代表国家行使。尽管农村集体经济组织可以修建和管理水库，但这并不意味着它们就拥有了水库中水的所有权。

选项B：“错误” - 这个选项正确地指出了农村集体经济组织并不拥有其水塘和由其修建管理的水库中的水的所有权。如前所述，水资源的所有权归国家所有，而非农村集体经济组织。

答案选择：

因此，本题的正确答案是B，即“错误”。这是因为尽管农村集体经济组织可以修建和管理水库，但水资源的所有权仍然归国家所有，它们只是拥有使用、管理和保护这些水资源的权利，而非所有权。