对以土石坝为主体的枢纽工程，其施工总体布置的重点应放在（）等方面，并以此为主线来规划布置其它 施工设施和施工工厂。

解析这道题时，我们首先要明确题目背景是针对以土石坝为主体的枢纽工程，其施工总体布置的重点。土石坝主要由土石料构筑而成，因此施工过程中的土石料管理是整个工程的核心。

现在，我们逐一分析选项：

A. 土石料开采：土石料的开采是土石坝建设的第一步，也是关键步骤。没有充足的土石料供应，后续的施工将无法进行。因此，合理规划和布置土石料开采场地是施工总体布置的重点。

B. 土石料加工：开采出的土石料往往需要进行一定程度的加工（如破碎、筛分等）以满足坝体建设的质量要求。因此，土石料加工设施的布置也是施工总体布置的重要部分。

C. 土石料堆置：加工后的土石料需要妥善堆置，以便后续运输上坝。堆置场地的选择和布置直接影响到土石料的运输效率和成本，因此也是施工总体布置的重点之一。

D. 土石料上坝线路：上坝线路是土石料从堆置场到坝体之间的运输通道，其布置直接影响到施工效率和安全。合理规划和布置上坝线路是确保土石坝顺利施工的关键。

E. 混凝土拌合与运输：虽然混凝土拌合与运输在水利工程建设中也很重要，但在此题目背景下，它并不是以土石坝为主体的枢纽工程的施工总体布置的重点。土石坝主要由土石料构成，而非混凝土。

综上所述，选项A、B、C、D均是以土石坝为主体的枢纽工程施工总体布置的重点，而选项E与本题背景不符。因此，正确答案是ABCD。