混凝土配合比设计时，水灰比是依据水泥的强度等级和石子的种类确定的。

这是一道关于混凝土配合比设计原理的题目。首先，我们需要理解混凝土配合比设计中水灰比（W/C，即水与水泥的质量比）的确定依据。

现在，我们来分析题目中的各个选项：

A. 正确：这个选项认为水灰比仅依据水泥的强度等级和石子的种类确定。然而，这并不全面。

B. 错误：这个选项否认了A选项的说法，暗示水灰比的确定还涉及其他因素。

接下来，我们详细解释为什么选择B（错误）：

水泥的强度等级：水泥的强度等级确实是影响水灰比的一个重要因素。不同强度等级的水泥，其水化反应速度和强度发展特性不同，因此需要不同的水灰比来达到预期的混凝土强度。

石子的种类：虽然石子的种类（如碎石、卵石等）对混凝土的物理性能（如工作性、密实性）有一定影响，但它并不是决定水灰比的主要因素。石子主要影响混凝土的骨料级配和空隙率，进而影响混凝土的强度和耐久性，但这一影响通常是通过调整骨料比例和混凝土配合比的整体设计来实现的，而非单独通过调整水灰比。

其他重要因素：除了水泥强度等级外，水灰比的确定还需考虑混凝土的强度等级、工作性要求（如坍落度）、耐久性要求（如抗渗性、抗冻性）、经济性以及环境条件（如温度、湿度）等因素。这些因素共同决定了水灰比的选择。

综上所述，虽然水泥的强度等级是影响水灰比的一个重要因素，但水灰比的确定并非仅依据水泥的强度等级和石子的种类。因此，题目中的说法“水灰比是依据水泥的强度等级和石子的种类确定的”是不全面的，所以答案是B（错误）。