凡影响行车的施工及故障地点的线路，均应设置（ ）。

选项解析：

A. 作业标：作业标是用来标识正在施工或作业的地点，提醒施工人员和其他人员注意安全，但它并不直接用于影响行车的安全防护。

B. 停车信号：停车信号用于指示列车停车，一般在车站或特定地点使用，而不是针对影响行车的施工及故障地点的线路设置。

C. 慢行牌：慢行牌用于指示列车减速慢行，适用于列车接近施工或潜在危险区域时使用，但它不足以全面防护影响行车的施工及故障地点。

D. 防护：防护措施是指在施工或故障地点采取的一系列安全措施，用来确保列车行车安全，防止事故发生。它可能包括设置临时信号、标志、围栏等，是最全面、最直接对应题目要求的选项。

选择D的原因： 这道题要求选出的是针对影响行车的施工及故障地点的线路应设置的措施。从四个选项中，只有“防护”涵盖了在施工及故障地点采取的一切必要安全措施，以确保行车安全。因此，正确答案是D。其他选项虽然也是安全措施的一部分，但它们或者是针对特定情境（如停车信号、慢行牌），或者是仅起到标识作用（如作业标），不能完全满足题目中提到的全面防护需求。