1956年三大改造完成,我国的经济结构、阶级关系发生了根本变化,标志着( ).

这是一道关于中国近现代历史的问题，主要考察1956年三大改造完成后，中国经济结构、阶级关系发生的变化及其历史意义。我们来逐一分析各个选项：

A项：中国历史上长达数千年的阶级剥削制度的结束

三大改造（即对农业、手工业和资本主义工商业的社会主义改造）完成后，生产资料私有制转变为社会主义公有制，这标志着剥削阶级被消灭，阶级剥削制度在中国历史上结束。因此，A项正确。

B项：实现了由新民主主义向社会主义的转变

三大改造的完成，标志着中国从新民主主义社会过渡到了社会主义社会，实现了社会制度的历史性转变。所以，B项正确。

C项：社会主义基本制度在我国初步确立，我国进入社会主义初级阶段

三大改造的完成，确立了社会主义公有制的主体地位，标志着社会主义基本制度在中国的初步确立，中国由此进入了社会主义初级阶段。因此，C项正确。

D项：标志着我国进入社会主义改革开放时期

这一选项的时间节点有误。改革开放开始于1978年，而不是1956年三大改造完成时。所以，D项错误。

综上所述，正确答案是A、B、C，因为它们准确地反映了1956年三大改造完成后中国经济结构、阶级关系发生的变化及其历史意义。