中小学校党组织关系一般隶属于市、县级党委教育工作部门或教育行政部门党组织,所在乡镇(街道)、村(社区)党组织().

选项解析：

A. 帮助管理：这个选项意味着乡镇（街道）、村（社区）党组织在中小学校党组织管理中起到的是一种辅助性作用，但不是常规的或制度性的管理职责。

B. 协助管理：这个选项表明乡镇（街道）、村（社区）党组织在中小学校党组织管理中起到的是辅助和协作的作用，按照上级党委教育工作部门或教育行政部门的要求，参与和配合管理工作。

C. 共同管理：这个选项表示乡镇（街道）、村（社区）党组织与市、县级党委教育工作部门或教育行政部门党组织共同承担中小学校党组织的直接管理责任。

D. 指导管理：这个选项意味着乡镇（街道）、村（社区）党组织在管理中小学校党组织时起到的是一种指导和监督的角色，通常是上级对下级的管理方式。

选择答案B的原因：

根据《中国共产党章程》和有关党的基层组织建设的文件精神，中小学校党组织是党在教育领域的基础组织，其管理关系一般隶属于市、县级党委教育工作部门或教育行政部门党组织。乡镇（街道）、村（社区）党组织在不直接管理学校党组织的同时，应当发挥地理优势，协助和支持学校党组织的建设和发展。因此，选项B“协助管理”更准确地描述了乡镇（街道）、村（社区）党组织在中小学校党组织管理中的角色和作用，是正确答案。