40.负责航行值班的驾驶员应:

解析：题目解析 在海上航行时，需要确保主机有一定的储备，以应对突发情况。因此，主机的海上转速通常定为额定转数的96~97%。选项D符合这个要求，因此为正确答案。

解析：下列哪些情况下船舶应以安全航速行驶? Ⅰ、将要靠码头的船舶；Ⅱ、刚起锚欲驶往航道的船舶；Ⅲ、从事使其驶离航向的能力严重受到限制的作业的船舶。根据国际航行规则第6条的规定，船舶应以安全航速航行，以免对船舶、人员和环境造成危险。在这三种情况下，船舶都需要保持安全航速，以保证船舶航行安全。因此，选项D是正确答案。

解析：题目解析：交叉相遇是指两艘船舶在靠近对方前方，航向存在交叉的情况。根据国际海上避碰规则COLREGs的规定，交叉相遇局面条款适用于两艘机动船之间。因此，答案选B。

解析：应鸣放一长一短一长一短的声号。这是因为当被追越船同意追越时，追越船应该发出一系列特定的声号来表明其意图和行动，其中一长一短一长一短的声号表示追越船将从被追越船的左舷追越。

解析：题目解析：吃水和可用水深的关系是船舶航行的基本条件，与安全航速直接相关；风浪和流的情况以及靠近危险物的情况都会影响船舶的操纵性能和安全性；船舶的操纵性能也是决定安全航速的重要因素。因此，选项D正确，包括了所有的考虑因素。

解析：题目解析 根据COLREGs规则，当两船处于交叉航行状态并存在碰撞危险时，让路的船应该向右转弯。因此，本题答案为A，即右转并鸣放一短声。船长和驾驶员在航行中应该牢记这个规则，以确保船舶的安全操作。

解析：题目解析：国际海上避碰规则规定，各国政府可以为军舰及护航下的船舶制定额外的队形灯、信号灯、笛号或号型，以保证船舶在执行任务时的安全性和保密性。因此，选项A是正确的答案。

解析：题目解析：本题考察的是驾驶和航行规则中对避免碰撞行动的规定。根据规则，船舶应该采取积极的措施来避免碰撞，不论是在任何能见度情况下。因此，选项 D“任何能见度情况”是正确答案。

解析：操纵能力受到限制的船舶是指由于工作性质使其按照本规则条款的要求进行操纵的能力受到限制,因而不能给他船让路的船舶。正确答案是B。根据题干中的“工作性质”和“按照本规则条款的要求进行操纵的能力受到限制”可以判断出正确答案为B，其他选项虽然涉及操纵能力受到限制的情况，但是并没有涉及不能给他船让路的情况。

解析：通过哪种标准试验方法来判断船舶的停船性能？答案是D，倒车试验。倒车试验是一种用于评估船舶停船性能的标准试验方法。通过这种试验，可以测量船舶在不同速度下的停船距离和时间，从而评估其停船性能。因此，答案为D。