鲜活农产品运输车辆整车合法装载容积的判定方式正确的有

本题考察的是鲜活农产品运输车辆整车合法装载容积的判定方式。

A选项：“普通货车:以车辆车厢长、宽、高计算总容积”。这是正确的，因为普通货车的装载容积通常就是根据其车厢的长、宽、高来计算的，这是判断其是否合法装载鲜活农产品的一个基本标准。

B选项：“厢式货车(封闭货车):以车辆货厢的总容积，判断是否合格”。这也是正确的，厢式货车的装载容积由其封闭的货厢决定，通过测量货厢的长、宽、高来计算总容积，从而判断其是否满足整车合法装载的要求。

C选项：“特殊结构货车(水箱式):装运的水体中载运有可见活动水产品较少的，视同为整车装载”。这是错误的。水箱式货车主要用于运输水产品等鲜活农产品时，其装载标准并非以水体中活动水产品的数量为准，而是以其实际装载的鲜活农产品是否占满车厢容积为标准。因此，不能仅凭水体中活动水产品的数量来判断是否整车装载。

D选项：“敞篷货车(平板式、栅栏式):以本车长、宽以及比照同轴型普通货车车厢高度计算的总容积，判断是否合格”。这是正确的，敞篷货车的装载容积需要根据其实际的车厢长、宽，并参考同类型普通货车的车厢高度来计算，以确保其装载的鲜活农产品符合整车合法装载的要求。

E选项：“仓栅式货车:以车辆车厢栏板长、宽、高计算总容积”。这同样是正确的，仓栅式货车的装载容积由其车厢栏板的长、宽、高决定，这是判断其是否整车合法装载鲜活农产品的重要依据。

综上所述，正确答案是ABDE。这些选项都准确地描述了不同类型货车在运输鲜活农产品时，如何判断其是否整车合法装载的容积标准。