为加强水库大坝安全管理，保障人民生命财产安全，根据《山东省实施〈水库大坝安全管理条例〉办法》规定，水利部门所管辖的大坝实行（）管理。

解析：

本题考察的是水库大坝安全管理的原则，特别是针对《山东省实施〈水库大坝安全管理条例〉办法》中的相关规定。

A. 分级管理：这是水利工程管理中的一项基本原则，旨在根据水库大坝的重要性、规模、功能等因素，将其划分为不同的管理级别，由相应级别的水利部门或机构进行管理和监督。这种管理方式能够确保各级管理机构明确职责，有效履行对水库大坝的安全管理职责，因此是符合题目要求的正确答案。

B. 分等管理：虽然水库大坝可能会根据某些标准（如防洪标准、库容等）进行等级划分，但“分等管理”并不是水利部门直接管理水库大坝的基本原则或方式。它更多是用于描述水库大坝的某种属性或分类，而非管理方式，因此不是本题的正确答案。

C. 流域管理：流域管理通常指的是以流域为单元，对流域内的水资源、水环境、水生态等进行统一规划、管理和保护。虽然流域管理在水资源管理中占有重要地位，但它并不直接等同于对水库大坝的“管理方式”。水库大坝可能位于某个流域内，但流域管理并不特指对水库大坝的分级管理，因此C选项不正确。

D. 区域管理：区域管理通常指的是按照行政区划或地理区域对某一区域内的事物进行管理。虽然水库大坝可能位于某个特定的行政区域内，但“区域管理”并不特指对水库大坝的分级管理，也不符合《山东省实施〈水库大坝安全管理条例〉办法》中关于水库大坝管理的具体规定，因此D选项同样不正确。

综上所述，正确答案是A，即水利部门所管辖的大坝实行分级管理。