对未经批准在河床、河滩内修建建筑物的，不可以对该行为人（）。

本题考察的是对水利工程管理相关法律法规的理解和应用。

首先，我们需要理解题目背景：对于未经批准在河床、河滩内修建建筑物的行为，我们需要分析各个选项的合法性和适用性。

A选项（责令其停止违法行为）：根据相关法律法规，对于未经批准擅自进行的建设活动，行政机关有权责令其立即停止。这是为了及时制止可能对河道安全、防洪等造成不利影响的行为，因此A选项是合理的。

B选项（限期清除障碍）：对于已经形成的违法建筑物，行政机关有权要求行为人限期清除，以恢复河道原状，确保河道的正常功能和安全。所以B选项也是正确的。

C选项（罚款）：作为对违法行为的处罚措施之一，罚款是常见的行政处罚方式。对于未经批准修建建筑物的行为，行政机关可以依法对其处以罚款，以示惩戒并弥补可能造成的损失。因此C选项同样正确。

D选项（行政拘留）：行政拘留是限制人身自由的行政处罚措施，通常适用于违反治安管理处罚法的行为。而本题中涉及的是水利工程管理方面的违法行为，并不涉及治安管理范畴，因此不适用行政拘留。此外，从行政处罚的适度性和必要性原则出发，对于此类违法行为，采取责令停止、限期清除和罚款等措施已足够，无需采取更为严厉的行政拘留措施。

综上所述，对未经批准在河床、河滩内修建建筑物的行为人，不可以采取的行政处罚措施是D选项（行政拘留）。