渠道的输水损失，最主要的影响因素是（）。

选项解析如下：

A. 渠床土质：渠床土质会影响渠道的渗漏情况，但它不是最主要的影响因素。不同土质的渗透性不同，但通过采取适当的防渗措施可以降低其影响。

B. 渠道施工质量：施工质量的高低确实会影响渠道的输水损失，比如施工缺陷可能导致渠道漏水。然而，即使施工质量很高，如果没有采取有效的防渗措施，输水损失仍然会较大。

C. 渠道防渗措施：这是最主要的影响因素。采取有效的防渗措施可以显著减少渠道输水过程中的水量损失，如铺设防渗膜、使用防渗混凝土等。

D. 渠道工作制度：渠道的工作制度（如调度、运行方式等）会影响输水效率，但与防渗措施相比，它对输水损失的影响较小。

为什么选这个答案： 选择C（渠道防渗措施）是因为它是直接针对减少输水损失的措施。在所有选项中，渠道防渗措施对减少输水损失的作用最为直接和显著。通过采取有效的防渗措施，可以最大限度地降低因土壤渗透、施工缺陷等因素造成的输水损失。因此，C选项是最合适的答案。