小流域与同一地区中等流域相比较，其多年平均径流深两者相等。

这道题目考查的是关于不同尺度流域径流特征的理解。

选项分析：

A. 正确：如果选择这个选项，意味着认为小流域和中等流域在相同地区的多年平均径流深度是相同的。但实际上，由于流域面积大小的不同，它们受到的降雨分布、地形地貌、土壤类型等因素的影响程度可能会有所不同。
B. 错误：正确答案选择了这一项，表示小流域和中等流域在相同地区的多年平均径流深度并不一定相等。

解析：
多年平均径流深是指一定时间内通过某一断面的径流总量除以该断面以上流域面积得到的结果。理论上，在同样的气候条件下，不同大小的流域应该有相似的径流系数（即径流量与降水量之比），但是实际上由于小流域可能具有更加均匀的地表条件、土壤特性以及人类活动影响较小等特点，因此其径流系数可能会与较大流域有所差异。

在实际情况中，小流域因为面积较小，可能会更快地达到饱和状态，导致更多的地表径流；而较大的流域由于面积大，可能有更多的地下水补给和蓄水能力，从而使得径流特征有所不同。因此，不能简单地说两者的多年平均径流深完全相等，所以答案是B. 错误。