东风4D型机车柴油机气缸套检修时,测量内径第三位置距上端面()。

这道题目考察的是东风4D型机车柴油机气缸套检修时，关于内径测量第三位置距上端面具体距离的知识点。

我们来逐一分析各个选项：

A. 350~400mm：这个范围明显偏短，通常气缸套的长度以及为了准确反映气缸套中下部的磨损情况，测量位置不会如此接近上端面。

B. 480~500mm：这个范围符合气缸套中下部磨损测量的常规位置，能够较好地反映气缸套的实际磨损状况，特别是在长时间使用后，中下部的磨损更为关键。

C. 400~450mm：虽然这个范围也在气缸套的中下部，但相较于B选项，它可能不是最优的测量位置，因为更靠近下部的测量能更准确地反映气缸套的长期磨损情况。

D. 380~420mm：同样，这个范围也偏近于气缸套的上部，不利于准确评估气缸套的整体磨损，尤其是中下部的磨损情况。

综上所述，考虑到气缸套磨损的评估需要重点关注其中下部的磨损情况，以及为了获得更准确的测量数据，B选项“480~500mm”作为内径测量的第三位置距上端面的距离是最合适的。因此，正确答案是B。