侵占铁路建设用地的,由()土地管理部门责令停止侵占,赔偿损失

**解析：** 根据《中华人民共和国铁路法》的相关规定，对于侵占铁路建设用地的行为，其行政处罚主体有明确的法律界定。 1. **法律依据**： 《中华人民共和国铁路法》第三十七条规定：“禁止在铁路线路两侧地界以内或者铁路用地范围内修建建筑物、构筑物。……侵占铁路建设用地的，由**县级以上地方人民政府**土地管理部门责令停止侵占、赔偿损失。” 2. **选项分析**： * **A. 地级以上人民政府**：法律条文并未将权限限定在“地级”以上，县级政府土地管理部门同样拥有此职权，故该选项范围过窄。 * **B. 县级以上人民政府**：符合法律规定。在我国行政管理体系中，“县级以上地方人民政府土地管理部门”是处理此类土地违法案件的法定行政执法主体。 * **C. 国务院**：国务院是最高国家行政机关，不直接处理具体的局部土地侵占案件，故排除。 * **D. 铁路**：铁路部门（如铁路局、铁路公司）是企业或行业管理机构，不具备行政执法权，不能直接责令停止侵占或进行行政处罚，只能配合相关部门执法或提起民事诉讼，故排除。 因此，正确答案为 **B**。