案例描述:2021年7月6日:17:00,一辆蓝牌皖A***客一类非ETC用户车辆,从A站通行出口ETC/MTC混合车道时,收费人员读取CPC卡后,系统提示”超时”。当班收费人员喊班长到现场处理,经询问,该车为**高速服务区员工车辆,通过核查该车行驶轨迹,收费人员据实收取,驾驶员当场使用本车ETC单卡缴纳通行费**元。车辆驶离收费道口后驾驶员对收费存在异议,并进行投诉。(4)持ETC单卡客户,ETC卡(),不作为通行介质使用,入出口均按非ETC车辆处理。

解析这道题目，我们首先需要理解ETC单卡在不同场景下的使用规则，并结合案例描述中的具体情况来进行分析。

题目描述了一个蓝牌非ETC用户车辆在通过ETC/MTC混合车道时遇到“超时”问题，并最终使用ETC单卡支付了通行费。但驾驶员事后对收费存在异议并进行了投诉。题目询问的是关于ETC单卡的使用规则，特别是关于其是否可以作为通行介质使用。

接下来，我们逐一分析选项：

A. 可做支付使用：这个选项虽然提到了支付功能，但没有明确指出ETC单卡是否可以作为通行介质使用，表述不够准确。

B. 仅作支付使用：这个选项明确指出ETC单卡仅用于支付，不作为通行介质使用。这与题目描述中“持ETC单卡客户，在入出口均按非ETC车辆处理”相符合，因为如果ETC单卡仅用于支付，那么车辆就需要按照非ETC车辆的流程来处理。

C. 可做交易使用：此选项的“交易”一词含义模糊，可能包括支付但不限于支付，且没有直接回答是否可作为通行介质使用。

D. 仅作交易使用：同样，“交易”一词的模糊性使得这个选项不够精确，且未直接关联到通行介质的使用。

E. 可作交易和支付使用：这个选项虽然包含了支付功能，但也包含了“交易”这一模糊概念，并且没有明确ETC单卡不可作为通行介质使用。

综上所述，根据题目描述和ETC单卡的实际使用规则，我们可以确定ETC单卡在不与OBU（车载电子标签）结合使用时，仅作为支付工具，并不具备作为通行介质的功能。因此，车辆需要按照非ETC车辆的流程来处理。

所以，正确答案是B：“仅作支付使用”。