现金车辆认定为客户责任的,系统根据稽核结果生成补费系统与追缴名单,()限制通行与追缴通行费。

解析这道题目，我们首先要理解题目中的关键信息和各个选项的含义。题目描述的是，在现金车辆被认定为客户责任时，系统会根据稽核结果生成补费系统和追缴名单，并随后采取某种措施来限制通行与追缴通行费。

现在，我们逐一分析各个选项：

A. 入口：这个选项指的是高速公路或收费站的入口。然而，仅仅在入口进行限制并不能全面有效地追缴通行费，因为车辆可能已经在其他地方行驶并产生了费用。此外，入口限制也不便于对所有应追缴费用的车辆进行统一管理。

B. 出口：出口限制虽然能在一定程度上阻止未缴费车辆离开，但同样存在局限性。它不能覆盖到已经离开该出口的车辆，也无法对全省或更广泛范围内的车辆进行统一管理。

C. 全省：虽然这个选项比前两个选项更为广泛，但仍然局限于一个省份之内。在现代交通网络中，车辆可能跨越多个省份行驶，因此全省的限制并不足以全面覆盖所有应追缴费用的车辆。

D. 全网：这个选项指的是全国范围内的交通网络。在现金车辆被认定为客户责任并需要追缴通行费时，采取全网限制通行与追缴通行费的措施是最全面、最有效的。它可以确保无论车辆行驶到哪个省份或地区，都能被有效地追踪和管理，从而确保通行费的顺利追缴。

综上所述，选择D选项“全网”是因为它能够最全面、最有效地覆盖所有应追缴费用的车辆，确保通行费的顺利追缴。因此，正确答案是D。