对一年内混装不符合规定品种(或物品)超过()或者经查验属于假冒鲜活农产品运输车辆,记入”黑名单”。

选项解析：

A. 1次：这个选项表示只要有一次混装不符合规定品种或物品的情况，就会被记入“黑名单”。这可能会导致过于严格的管理，对于偶然的或无意的违规行为给予过重的惩罚。

B. 2次：这个选项意味着给予运输车辆两次违规的机会，在第三次违规时才会记入“黑名单”。这比选项A宽容一些，但仍然可能不足以防止偶然的违规。

C. 3次：这个选项提供了三次违规的机会，第四次违规时才记入“黑名单”。这样的规定能够在确保规定执行的同时，给予运输车辆一定的宽容度，允许犯错并改正。

D. 4次：这个选项给予了四次违规的机会，第五次才记入“黑名单”。这可能导致管理过于宽松，不利于及时制止违规行为，增加了管理风险。

为什么选择C：

选择C是因为它平衡了规定的严格执行与对违规行为的宽容度。三次违规的机会既能够提醒和警告违规者，又能够防止那些不是故意或经常违规的运输车辆被过早地记入“黑名单”。这样的规定有助于促进合规行为，同时避免对偶发或非恶意违规者造成过大的影响。因此，根据题库的答案，选择C是最合适的。