其他交易的出口交易记录应实时上传至省中心最晚不得超过()个自然日省中心收到出口交易记录后应将多省其他交易实时上传至部联网中心最晚不得超过()个自然日。

这是一道关于交通运输行业公路收费及监控系统中数据上传时间限制的题目。我们需要根据题目描述，确定其他交易的出口交易记录从收费站上传到省中心，以及从省中心上传到部联网中心的最晚自然日数。

首先，我们梳理题目中的关键信息：

题目询问的是其他交易的出口交易记录上传的时间限制。
第一个时间限制是：从收费站上传到省中心的最晚时间。
第二个时间限制是：从省中心上传到部联网中心的最晚时间。

接下来，我们分析每个选项：

A. 4：这个选项对于两个时间限制都显得过长，不符合实时上传的时效性要求。

B. 3：这个选项可能适用于其中一个时间限制。在交通运输行业，数据传输的时效性很重要，但通常不会将最终时间限制设置得特别短，以应对可能的网络延迟或数据处理时间。因此，这个选项可能适用于从省中心到部联网中心的上传时间限制。

C. 2：虽然这个选项表示的时间更短，但在实际操作中，可能需要一定的缓冲时间来确保数据的准确性和完整性，因此可能不适用于所有情况。

D. 1：这个选项表示的时间非常短，通常适用于需要高度实时性的数据传输。在交通运输行业，特别是收费和监控领域，数据的实时性至关重要，因此这个选项可能适用于从收费站到省中心的上传时间限制。

最后，我们结合题目中的“最晚不得超过”这一表述，以及交通运输行业对数据实时性的要求，可以推断：

从收费站上传到省中心的数据，由于直接关联到车辆的即时通行和费用计算，需要高度实时性，因此选择D选项（1个自然日）是合理的。
从省中心上传到部联网中心的数据，虽然也需要时效性，但可能不需要像收费站到省中心那样高的实时性，因为部联网中心主要负责跨省数据的汇总和分析。因此，选择B选项（3个自然日）作为这一阶段的上传时间限制是合理的。

综上所述，答案是BD。