预约平台将注册申请中的企业统一信用代码及预留手机号转发给部ETC发行平台,部ETC发行平台进行自动核验,核验通过后向预留手机号发送()验证码。

这道题目考察的是对ETC（电子不停车收费系统）注册申请流程中验证码发送方式的理解。我们可以根据题目描述和各个选项来逐一分析：

A. 微信：虽然微信是现代通讯中常用的工具，但在ETC注册申请的流程中，特别是涉及到验证码的发送，通常不会通过微信这样的社交平台进行，因为这涉及到安全性和隐私保护的问题。此外，题目中并未提及微信与验证码发送的直接关联。

B. 电话：电话验证码在某些场合下是存在的，但在此ETC注册申请的上下文中，电话验证码不是常见的做法。电话验证码通常需要人工接听并输入，这在自动化和效率上不如短信验证码。

C. 短信：短信验证码是验证用户身份的一种常见且安全的方式。在ETC注册申请中，通过短信发送验证码给用户预留的手机号，既方便又安全。用户只需在手机上查看短信并输入验证码即可完成验证，无需其他复杂操作。此外，题目中明确提到了“向预留手机号发送验证码”，这进一步支持了短信作为验证码发送方式的选项。

D. 小程序：小程序是微信等平台上的一种应用形式，它本身并不直接参与验证码的发送。在ETC注册申请的流程中，小程序可能用于提供用户界面或处理其他业务逻辑，但与验证码的发送无直接关联。

综上所述，根据题目描述和各个选项的分析，我们可以确定短信（C选项）是ETC注册申请中验证码的正确发送方式。因此，答案是C。