123.自然界中的氨基酸常见分类原则是

这是一道关于氨基酸分类原则的选择题。我们需要分析每个选项，并结合氨基酸分类的常识来确定正确答案。

首先，我们来分析各个选项：
A选项（按蛋白质来源分类）：虽然氨基酸是蛋白质的基本组成单位，但氨基酸本身并不直接按蛋白质来源进行分类。这种分类方式更多是针对蛋白质本身，而非其组成单位氨基酸。

B选项（按营养价值分类）：营养价值是评估氨基酸的一个重要方面，但它不是氨基酸分类的唯一或主要原则。单独以营养价值作为分类标准过于片面。

C选项（按化学结构分类）：化学结构是氨基酸分类的一个重要依据，它涉及到氨基酸的官能团、侧链等特征。然而，仅凭化学结构分类也不足以全面描述氨基酸的特性。

D选项（按营养价值和化学结构分类）：这个选项结合了氨基酸的化学结构和营养价值两个维度进行分类。化学结构反映了氨基酸的基本属性和功能，而营养价值则评估了其在生物体内的利用价值和重要性。这种综合分类方式能够更全面、准确地描述和区分不同类型的氨基酸。

综上所述，氨基酸在自然界中的常见分类原则应综合考虑其化学结构和营养价值。因此，正确答案是D选项（按营养价值和化学结构分类）。这种分类方式既考虑了氨基酸的化学特性，又考虑了其在生物体内的实际应用价值，是一种全面且科学的分类方法。