企业食品安全管理人员监督抽查考核指南由国务院食品安全监督管理部门（ ）、公布。

这道题目考察的是对企业食品安全管理人员监督抽查考核指南制定流程的理解。我们来逐一分析每个选项： A. 起草：起草是指初步撰写或拟定文件的过程，但并不是最终确定和发布的步骤。因此，虽然国务院食品安全监督管理部门可能参与了起草工作，但这不是答案。 B. 制定：制定意味着从无到有地创建一套规则、标准或者指导方针，并且通常包括了从起草到最终批准的整个过程。在这个过程中，不仅包含了文件内容的设计，还包括了对草案进行讨论、修改直至正式通过等环节。根据《中华人民共和国食品安全法》等相关法律法规的规定，国务院食品安全监督管理部门确实负责制定企业食品安全管理人员监督抽查考核的相关指南。因此，这是正确答案。 C. 审核：审核指的是对已经存在的材料进行检查以确保其符合特定的标准或要求。如果指南是由其他机构或部门起草的话，那么国务院食品安全监督管理部门可能会对其进行审核，但这并不意味着它直接“制定”了该指南。 D. 通知：通知一般是指将已有的信息告知相关人员或单位的行为。显然，在这里不符合题意，因为题目问的是谁来“制定”指南，而不是谁来传达这个指南的信息。 综上所述，正确答案是B. 制定，因为国务院食品安全监督管理部门负责整体规划并确立企业食品安全管理人员监督抽查考核的具体内容与实施办法。