某公安机关在办理行政案件中，以下证据先行登记保存的做法错误的有（）

答案解析：
A选项中，办案民警在证据可能灭失的情况下，应当立即采取措施进行先行登记保存，不需要等待所长同意。因此，A选项错误。
B选项中，办案民警应当将证据交给专门的保管人员进行保管，而不是交给内勤。因此，B选项错误。
C选项中，办案民警在进行证据先行登记保存时，应当给持有人开具扣押物品清单，以确保证据的安全和完整性。因此，C选项正确。
D选项中，如果证据持有人拒绝签名，办案民警应当在清单上注明证据持有人拒绝签名的情况，以确保记录的真实性。因此，D选项正确。

综上所述，正确答案为ABC。希望以上解析能帮助您理解并记住这个知识点。如果您有任何疑问，欢迎继续提问。如果您需要更多生动有趣的例子来帮助理解其他知识点，也请告诉我哦！我会尽力帮助您的。