（ ）负责做好进入控制区施工人员和车辆的安全检查

这道题目考察的是对于机场安全管理职责的理解。根据题干，“负责做好进入控制区施工人员和车辆的安全检查”的应该是专门负责安全检查工作的部门。

A. 安全检查总站：这是机场中通常负责对旅客、工作人员、车辆及货物进行安检的专业机构，因此它也是最有可能执行对进入控制区的人员和车辆进行安全检查的部门。
B. 航空安全保卫部：虽然名字中有“安全”，但它更多地涉及整体的航空安全策略制定与实施，而不是具体的安全检查工作。
C. 飞行区管理部：该部门主要负责飞行区（如跑道、滑行道等）的日常运营管理和维护，确保飞行区的安全运行，并不直接负责人员或车辆的安检工作。
D. 建设单位：建设单位一般是指在机场内进行建筑或改造工程的企业或团队，它们是需要接受安全检查的对象之一，而不是执行安全检查的一方。

因此，正确答案是A. 安全检查总站，因为只有这个选项明确指向了专门进行安全检查的机构。