一座灌溉水库，工程规模不变，灌区其他条件不变时，如设计保证率提高，设计有效灌溉面积将会（）。

这是一道关于水利灌溉工程设计的问题，特别是关于灌溉水库设计保证率与设计有效灌溉面积之间关系的问题。我们可以逐一分析每个选项，并结合灌溉工程的基本原理来确定正确答案。

A. （A）减少：

当灌溉水库的设计保证率提高时，意味着水库需要保证在更长时间或更不利的水文条件下仍能满足灌溉需求。这通常要求水库有更大的蓄水量或更可靠的供水能力。
如果水库的蓄水量和供水能力不变，而设计保证率提高，那么为了保证高保证率下的灌溉需求，就必须减少灌溉面积，以确保在不利条件下也能满足现有灌溉面积的用水需求。
因此，设计有效灌溉面积会减少，以适应更高的设计保证率。

B. （B）增大：

这个选项与提高设计保证率的要求相悖。提高设计保证率意味着在更不利的条件下仍能保证灌溉，这通常不会增加反而可能减少有效灌溉面积。

C. （C）不变：

设计保证率的提高直接关联到灌溉的可靠性和稳定性。如果设计保证率提高而有效灌溉面积不变，那么在水库蓄水量和供水能力不变的情况下，很难保证在更不利的条件下仍能满足灌溉需求。

D. （D）不确定：

这个选项虽然表达了一种可能性，但根据灌溉工程的基本原理，当设计保证率提高时，有效灌溉面积的变化是可以预测的，即通常会减少以确保灌溉的可靠性。

综上所述，当灌溉水库的设计保证率提高时，为了保证在更不利的条件下仍能满足灌溉需求，设计有效灌溉面积将会减少。因此，正确答案是A.减少。