429、.()应划为第二类防雷建筑物。

根据《建筑物防雷设计规范》（GB 50057），建筑物按照其重要性、使用性质、发生雷电事故的可能性和后果，被划分为不同的防雷类别。

A. 国家级计算中心：作为国家级的信息处理中心，它的重要性非常高，一旦遭受雷击可能导致数据丢失或系统瘫痪，对国家安全和社会经济造成严重影响，因此应归类为第二类防雷建筑物。

B. 省级档案馆：虽然也具有一定的重要性，但通常情况下其重要性低于国家级计算中心，并且对雷击的敏感度也不如计算中心高，因此一般不会被划为第二类防雷建筑物。

C. 炸药仓库：这类建筑由于存放易燃易爆物品，对防雷要求极高，一般会被划为第一类防雷建筑物，而不是第二类。

D. 年预计雷击次数大于和等于 0.06 次的一般性工业建筑物：这里的描述是指依据雷击频率来确定防雷类别，对于这类工业建筑物，如果符合这个条件，则有可能被划为第三类防雷建筑物，而不是第二类。

因此，正确答案是A，即国家级计算中心应划为第二类防雷建筑物。