山东省港口集团年吞吐量超过亿吨的货种有（ ）。

这道题考察的是山东省港口集团主要货物的吞吐量情况。题目中提到的年吞吐量超过亿吨的货种，根据提供的答案选项A（铁矿石）和C（原油），我们可以解析如下：

选项A. 铁矿石：铁矿石是钢铁生产的重要原料，在国际贸易中占有重要地位。由于中国是世界上最大的钢铁生产国之一，因此对于铁矿石的需求非常大。山东省作为中国的工业大省之一，其沿海港口自然成为铁矿石进口的重要通道。
选项B. 铝矾土：虽然铝矾土也是重要的工业原料之一，用于生产铝等产品，但相较于铁矿石和原油而言，在山东省港口集团的年吞吐量上可能没有达到亿吨级别。
选项C. 原油：随着中国经济的发展以及对能源需求的增长，原油成为中国进口量极大的商品之一。山东省拥有多个大型炼油厂，加上地理位置优势使得它成为了原油进出口的关键地区。
选项D. 煤炭：尽管煤炭在中国能源结构中占有很大比例，并且山东省也有自己的煤炭资源及消费市场，但从给出的答案来看，至少在山东省港口集团层面，煤炭的年度吞吐量似乎未被列为超过亿吨的主要货种之一。

综上所述，选择AC是因为铁矿石和原油这两种商品在山东省乃至整个中国市场都有着极高的需求量，从而导致它们通过山东省港口集团运输时能够达到年吞吐量超过亿吨的标准。而铝矾土和煤炭虽然也很重要，但在本题设定的情境下并没有达到同样的规模。