39.根据《建设工程安全生产管理条例》，设计单位的安全责任包括()。

解析：

本题考查《建设工程安全生产管理条例》中关于设计单位安全责任的规定。

- **A项正确**：根据条例，设计单位应在设计文件中注明涉及施工安全的重点部位和环节，这是其法定的安全责任之一。
- **B项正确**：对于采用新结构的建设工程，设计单位应当在设计中提出保障施工作业人员安全的措施建议，属于其安全责任范围。
- **C项错误**：审查危险性较大的专项施工方案是否符合强制性标准是监理单位的责任，而非设计单位的责任。
- **D项错误**：在投入使用后提出防范安全事故的指导性意见不属于设计单位的设计阶段安全责任。
- **E项错误**：审查监测方案是否符合设计要求不是设计单位的直接安全责任内容。

因此，正确答案为 **AB**。