案例描述:《超限运输车辆行驶公路管理规定》已于2016年8月18日经第18次部务会议通过,自2016年9月21日起施行。2017年4月25日,交通运输部办公厅又下发了关于贯彻实施《超限运输车辆行驶公路管理规定》的通知,对《规定》的颁布施行进一步进行了规范。(3)文件中要求各级交通运输主管部门要组织基层执法人员、许可办理人员、收费公路经营单位工作人员以及其他相关部门具体工作人员进行专题教育培训,重点强化()等内容的学习掌握。

这道题的答案是ABCD，因为这四个选项都是《超限运输车辆行驶公路管理规定》及其相关通知中强调需要重点学习和掌握的内容。

解析如下：

A. 超限运输认定标准：这是执行《超限运输车辆行驶公路管理规定》的基础，只有明确了超限运输的认定标准，才能准确判断哪些车辆属于超限运输，从而进行相应的管理和处罚。

B. 车型判别：车型判别是超限运输管理中的重要环节，因为不同车型有不同的限载、限高等标准。正确判别车型，是准确执行超限运输管理的前提。

C. 许可流程：对于需要进行超限运输的车辆，需要按照规定的流程进行许可申请和审批。掌握许可流程，可以确保超限运输的合法性和规范性。

D. 处罚标准：对于违反《超限运输车辆行驶公路管理规定》的行为，需要依据规定的处罚标准进行处罚。掌握处罚标准，可以确保执法的公正性和严肃性。

综上所述，这四个选项都是执行《超限运输车辆行驶公路管理规定》所必须掌握的重要内容，因此答案选择ABCD。