根据《交通运输部网络安全管理办法》规定建设开发安全质量实行终身负责制建设和运行期间因建设过程中产生的安全缺陷()负责整改。

选项解析：

A. 施工单位：通常负责具体的施工建设工作，按照设计图纸进行施工，但安全缺陷的整改责任一般不由其单独承担。

B. 建设单位：负责项目的整体建设和管理，包括项目的规划、设计、施工及监理等所有建设环节，因此对于建设过程中的安全缺陷负主要责任。

C. 监理单位：主要负责监督施工过程，确保工程质量和安全，但整改责任应由造成问题的责任方承担。

D. 设计单位：负责项目的设计工作，若安全缺陷源于设计问题，设计单位应负相应责任，但此题强调的是建设过程中的安全缺陷。

为什么选B（建设单位）： 根据《交通运输部网络安全管理办法》规定，建设和运行期间因建设过程中产生的安全缺陷，应由建设单位负责整改。这是因为建设单位在整个建设过程中起到统筹和管理的角色，对于建设过程中的各个环节都负有监督和管理责任。因此，对于在建设过程中产生的任何安全缺陷，建设单位应当负责组织整改，确保项目的安全质量符合规定要求。选择B选项符合相关法规和管理办法的规定。