运行合格证及运行规范修改存在以下情况可申请修改（）。

题目解析 题目中提到运行合格证及运行规范的修改申请情况。根据答案ABCD，可以得出以下解析： A选项：局方认为安全和公众利益允许修改，这是合理的，因为修改运行合格证和规范应该以确保安全和公众利益为首要考虑。 B选项：公司申请修改，并且局方认为安全和公众利益允许进行这种修改，这也是合理的，因为公司可能根据特定情况需要对合格证和规范进行修改，但需要局方的批准。 C选项：公司因运行原因需要申请修改，这也是合理的，因为公司运营中可能会出现需要调整合格证和规范的情况。 D选项：如公司存在严重失信行为记录，局方可以拒绝其申请的部分或全部修改，这是为了保证运营的安全性和诚信性，确保公司具备合适的资质来进行运营。 因此，答案ABCD涵盖了不同的申请情况和局方审核的原则。