燃气轮机运行时，辅机发生故障，必须先停用故障辅机，然后启动备用辅机。

燃气轮机是一种以燃料和空气为能源的轮机，用于发电和推进等方面。其辅机包括发电机、冷却水泵、润滑油泵等，是燃气轮机运行的重要组成部分。辅机如果发生故障，会对燃气轮机的正常运行产生影响，需要及时处理故障。对于题干中的说法，需要分情况具体分析。一般情况下，如果燃气轮机辅机发生故障，需要根据故障情况进行判断和处理。如果故障辅机影响燃气轮机的正常运行，需要先停用故障辅机，然后启动备用辅机进行替代。但是，在某些情况下，如果备用辅机不能及时启动或不能有效替代故障辅机，则需要进行其他的应急处理措施。综上所述，本题的答案是部分正确，不是绝对的对或不对，需要具体情况具体分析。因此，本题的正确答案应该是“错误”。