县级以上人民政府水行政主管部门应当根据河道建设规划，编制河道建设年度计划，报上级人民政府批准 后组织实施。

解析：

本题主要考察的是河道建设规划和年度计划的编制及审批流程。

首先，我们要明确题目中的关键信息：“县级以上人民政府水行政主管部门应当根据河道建设规划，编制河道建设年度计划，报上级人民政府批准后组织实施。” 这句话描述了河道建设年度计划的编制、报批和实施的流程。

接下来，我们逐一分析选项：

A. 正确：如果选择这个选项，就意味着题目中描述的流程是准确无误的。但实际上，在河道管理的实际操作中，河道建设年度计划的编制通常是由县级以上人民政府水行政主管部门负责，但这份计划并不需要报“上级人民政府”批准，而是需要报“本级人民政府”批准。这是因为河道建设年度计划通常涉及的是本行政区域内的事务，应由本级人民政府负责审批。

B. 错误：选择这个选项，即表示题目中描述的“报上级人民政府批准”这一环节是错误的。正如前面分析的，河道建设年度计划应当报本级人民政府批准，而不是上级人民政府。因此，这个选项是正确的。

综上所述，河道建设年度计划应当由县级以上人民政府水行政主管部门编制，并报本级人民政府批准后组织实施，而非上级人民政府。因此，正确答案是B选项：“错误”。