申请建设项目占用水域,涉及（）航道等水域,对水域功能产生较大影响的,应当提供占用水域影响评价报告。

选项解析：

A. 占用行洪：行洪是指河流在洪水期间保持畅通，以便洪水能够顺利下泄，不致造成泛滥。若建设项目占用水域，可能会阻塞或改变洪水流通路径，影响行洪功能。

B. 排涝：排涝是指排除地面积水，防止内涝。建设项目占用水域可能会影响正常排涝体系，降低区域排涝能力。

C. 供水：供水是指向公众提供饮用水或其他用途的水。建设项目可能会影响水源地或供水设施，进而影响供水安全。

D. 灌溉：灌溉是指为农业等用途提供水源。建设项目占用水域可能会减少可用水资源，影响灌溉需求。

为什么选这个答案：

这道题的正确答案是ABCD，因为申请建设项目占用水域，如果涉及到上述任何一项（行洪、排涝、供水、灌溉），即表示对水域功能有较大影响。根据相关法律法规，必须进行占用水域影响评价，以确保建设项目不会对水域功能造成不可逆转的负面影响。这四个选项均代表了水域的不同重要功能，因此都需要提供占用水域影响评价报告。