建设项目占用水域的管理，实行（）、占补平衡的原则。

解析这道题目时，我们首先要理解题目考察的是建设项目占用水域的管理原则。接下来，我们逐一分析各个选项，并结合这些原则在水利工程管理中的实际应用来判断哪个或哪些是正确的。

A. 严格控制：这是水域管理的基本原则之一。由于水域资源有限且对生态环境和防洪排涝等功能至关重要，因此建设项目占用水域必须受到严格控制，以确保水资源的合理利用和生态环境的保护。此选项正确。

B. 保护生态：水域是生态系统的重要组成部分，建设项目占用水域往往会对生态环境产生影响。因此，保护生态是水域管理不可或缺的原则。在占用水域时，必须考虑其对生态环境的影响，并采取措施予以保护。此选项正确。

C. 分类管理：不同类型的水域具有不同的功能和价值，因此需要根据其特点进行分类管理。例如，河流、湖泊、水库等水域的管理措施和要求可能有所不同。分类管理有助于更精准地保护和管理水域资源。此选项正确。

D. 统筹兼顾：虽然统筹兼顾是一个重要的管理原则，但在本题中，它并不是特指建设项目占用水域的管理原则。统筹兼顾通常用于描述在多个目标或利益之间寻求平衡和协调的过程，而本题关注的是占用水域的具体管理原则。因此，此选项与题目要求不完全吻合，故不正确。

综上所述，建设项目占用水域的管理原则应包括严格控制、保护生态和分类管理，因此正确答案是A、B、C。这三个原则共同构成了水域管理的基本框架，旨在确保水域资源的可持续利用和生态环境的良好保护。