国务院水行政主管部门会同国务院环境保护行政主管部门、有关部门和有关省、自治区、直辖市人民政府，按照流域综合规划、水资源保护规划和经济社会发展要求，拟定国家确定的重要江河、湖泊的（），报国务院批准。

这道题考察的是对水利工程管理相关政策文件的理解，特别是关于国家确定的重要江河、湖泊的规划制定过程。我们来逐一分析各个选项：

A. 水功能规划：虽然水功能规划是水资源管理和保护中的重要环节，但它并不特指为某一重要江河、湖泊所制定的具体区划。此选项较为宽泛，不符合题目中“拟定国家确定的重要江河、湖泊的...”这一具体描述。

B. 水资源区划：水资源区划通常是对水资源进行地理或行政上的分区管理，它并不直接针对特定江河、湖泊的水功能或水质目标进行规划。因此，这个选项也不符合题目要求。

C. 水功能区划：水功能区划正是针对特定区域（如国家确定的重要江河、湖泊）内的水资源，根据其自然属性和社会需求，划分出的具有特定功能的水域，并明确其水质目标和保护措施。这与题目描述高度吻合，是正确答案。

D. 水中长期规划：水中长期规划通常涉及水资源开发利用、节约保护、防洪抗旱、水生态治理等多个方面的长远规划和战略部署，它并不特指某一江河、湖泊的水功能区划。

综上所述，选项C“水功能区划”最符合题目要求，因为它直接对应了为特定江河、湖泊制定的、具有明确水质目标和保护措施的区划。因此，正确答案是C。