二类坝实际抗御洪水标准低于水利部部颁水利枢纽工程除险加固近期非常运用标准。

解析：

首先，我们需要明确题目中涉及的几个核心概念：

二类坝：在水利工程中，通常将大坝按照其安全状况进行分类，如一类坝（安全状况良好）、二类坝（存在某些问题但总体可控）、三类坝（存在严重问题，安全状况差）。这里的“二类坝”指的是存在某些问题但仍处于可控状态的大坝。

实际抗御洪水标准：指的是大坝当前能够抵御的最大洪水流量或水位等级。

水利部部颁水利枢纽工程除险加固近期非常运用标准：这是水利部针对水利枢纽工程（包括大坝）制定的一个安全标准，特别是在进行除险加固工作时需要达到的一个近期内的非常运用（即紧急情况下的使用）标准。这个标准通常是为了确保大坝在紧急情况下也能保持一定的安全水平。

接下来，我们分析题目中的描述：“二类坝实际抗御洪水标准低于水利部部颁水利枢纽工程除险加固近期非常运用标准。”

A选项“正确”意味着二类坝的防洪能力确实低于这个紧急情况下的运用标准，但从实际工程管理的角度来看，这并不合理。因为即使是大坝存在问题（如二类坝），其防洪能力也应当至少满足一定的基本标准，特别是紧急情况下的非常运用标准。如果连这个标准都达不到，那么该大坝的安全状况将非常堪忧，很可能会被归类为更危险的三类坝。

B选项“错误”则意味着二类坝的实际抗御洪水标准并不低于水利部制定的这个紧急情况下的运用标准。这是更合理的，因为即使大坝存在一些问题，为了保证其在紧急情况下的基本安全，其防洪能力也必须达到一定的标准。

因此，答案是B选项“错误”。这是因为在实际的工程管理中，二类坝虽然存在一些问题，但其防洪能力通常会被要求达到或超过紧急情况下的运用标准，以确保大坝在紧急情况下仍能保持一定的安全水平。