以下哪项不属于施工组织设计的内容（）。

解析如下：

A. 施工导流设计：这是施工组织设计的一部分，因为它涉及在施工期间如何管理和控制水流，确保工程安全进行。因此，它属于施工组织设计的内容。
B. 施工交通运输（布置）：这也属于施工组织设计的一部分，因为合理的交通运输布置是保证材料、设备及人员顺利进出施工现场的基础。
C. 主体结构防渗系统设计：主体结构的防渗设计通常是工程设计的一部分，而不是施工组织设计的内容。主体结构防渗涉及到的是建筑物本身的防水设计，更多的是建筑设计范畴内的工作。
D. 施工工厂设施和辅助设施配套：这也是施工组织设计的一部分，因为它关系到施工期间所需的生产能力和支持系统的安排。

正确答案为C，因为主体结构防渗系统设计更多地与建筑本身的设计相关，而不直接涉及如何组织和实施建设过程中的具体施工活动。