《山东省港口集团有限公司消防安全管理办法》要求，人员密集场所、易燃易爆危险品企业火灾高危单位的（）、（），应当按照国家规定取得注册消防工程师资格。

根据《山东省港口集团有限公司消防安全管理办法》的要求，对于人员密集场所、易燃易爆危险品企业等火灾高危单位，消防安全管理人（A）以及消防工作归口职能部门的负责人（B）应当按照国家规定取得注册消防工程师资格。这是因为这两个职位在单位的消防安全工作中起着至关重要的作用，他们需要具备专业的消防安全知识和管理能力，以确保能够有效预防和应对可能发生的火灾事故。

选择这两个答案的原因如下：

消防安全管理人（A）：负责整个单位或场所的消防安全管理工作，包括制定和实施消防安全管理制度、组织消防安全培训、检查和消除火灾隐患等。因此，消防安全管理人需要有较高的专业水平和管理能力，必须持有注册消防工程师资格证书。

消防工作归口职能部门的负责人（B）：是指专门负责单位内部消防安全工作的部门领导，其职责包括但不限于监督消防安全措施的执行情况、指导和协助其他部门开展消防安全工作等。该职位同样需要具备相应的专业知识和技术能力，以确保能够有效地履行职责。

而选项C（主要负责人）和D（分管消防工作负责人），虽然在单位消防安全中也扮演重要角色，但是根据现行法律法规的要求，并不需要强制性地持有注册消防工程师资格证书。不过，在实际操作中，鼓励这些岗位上的人员通过学习和考试获得相关资质，以便更好地承担起消防安全的责任。