绿色港口评价不适用以下哪种码头？

这是一道定义判断类型的问题，我们需要分析绿色港口评价体系的适用范围，并从提供的选项中找出不适用该评价体系的码头类型。

首先，理解绿色港口评价的核心意义：它通常关注于港口的环保性能、资源利用效率、能源节约以及减少对环境的影响等方面。这种评价体系旨在推动港口向更加可持续、环保的方向发展。

接下来，分析各个选项：
A选项（专业化集装箱码头）：这类码头通常处理大量的集装箱货物，其运营效率和环保性能对整体港口评价至关重要。因此，绿色港口评价适用于此类码头。

B选项（专业化干散货码头）：干散货码头处理如煤炭、矿石等大宗货物，其运营过程中可能产生较大的环境影响。因此，绿色港口评价同样适用于此类码头，以评估其环保措施的有效性。

C选项（邮轮码头）：邮轮码头作为旅游和客运的重要设施，其环保性能和可持续性同样受到关注。绿色港口评价可以帮助邮轮码头提升服务质量，同时减少对环境的影响。

D选项（件杂货码头）：虽然件杂货码头也是港口运营的重要组成部分，但其货物种类繁多，处理流程相对复杂，且不一定具备集装箱码头或干散货码头的规模化和标准化特点。在绿色港口评价中，可能更侧重于那些对整体环境影响更大、更易于实施统一环保标准的码头类型。因此，相对于其他选项，件杂货码头可能不是绿色港口评价的主要关注点。

综上所述，根据绿色港口评价的核心意义和适用范围，可以判断D选项（件杂货码头）是绿色港口评价不适用的码头类型。
因此，答案是D。