案例描述:广东某收费站绿色通道驶入一辆蓝色二轴半挂货车(装载联合收割机),司机向当班收费员出示了通行卡和联合收割机插秧机跨区作业证,司机提出免费要求。现场人员目测蓝色货车的外廓宽度3.25米,查看车辆行驶证发现该车装载已超过额定载重量。(5)以下哪些行为不属于业务操作违规?()

本题考察的是对“绿色通道”车辆免费通行政策及相关业务操作规定的理解。

A选项：根据绿色通道政策，装载鲜活农产品（包括联合收割机）的车辆，在符合一定条件下可以享受免费通行的政策。这些条件通常包括车辆类型、装载的货物种类、装载量等，但并不直接涉及车辆的外廓尺寸或是否超重。因此，现场人员以车辆外廓尺寸超限、车辆超重为由判定不合格，是违反了绿色通道政策的，属于业务操作违规。故A选项错误。

B选项：虽然《跨区作业证》是联合收割机享受免费通行政策的一个重要凭证，但如果现场人员发现该证件存在伪造、涂改或其他不合格的情况，那么判定不合格是合理的。然而，题目中并未提及《跨区作业证》存在任何问题，因此以《跨区作业证》不合格为由判定不合格在此情境下是不适用的，但这并不构成业务操作违规，因为这是一个基于证件真实性的合理判断。然而，在本题的选择中，B选项是唯一一个不直接违反绿色通道政策或业务操作规定的选项，因此是正确答案。

C选项：绿色通道政策并未要求车辆必须有入口信息才能享受免费通行。车辆是否有入口信息，与其是否装载了符合政策的鲜活农产品无直接关联。因此，现场人员以车辆无入口信息为由判定不合格，是违反了绿色通道政策的，属于业务操作违规。故C选项错误。

D选项：如果现场人员发现车辆不符合绿色通道政策的要求（如装载的货物不属于鲜活农产品），那么他们应该按照规定进行查验登记，并按普通货车进行收费。如果未进行查验登记就直接按普通货车收费，那么这是违反了业务操作规定的，因为查验登记是确保政策执行透明、公正的重要步骤。故D选项错误。

综上所述，正确答案是B选项。