违反《收费公路管理条例》的规定,政府还贷公路的管理者未将车辆通行费足额存入财政专户或者未将转让()权益的收入全额缴入()的,由财政部门予以追缴、补齐;对负有责任的主管人员和其他直接责任人员,依法给予记过直至开除的行政处分。

此题考察的是《收费公路管理条例》的相关规定。

选项解析： A. 政府还贷公路：指的是由政府贷款修建，通过收取车辆通行费来偿还贷款的公路。 B. 非经营性公路：通常指不收费的公路，其建设和维护一般由政府财政直接承担。 C. 财政专户：是政府为特定用途设立的资金账户，专门用于存储和管理特定资金。 D. 国库：是国家财政资金的总账户，所有政府收入最终都要缴入国库。

为什么选AD： 根据《收费公路管理条例》，政府还贷公路的车辆通行费应当足额存入财政专户，确保资金专项用于偿还贷款。同时，如果涉及到转让政府还贷公路权益的收入，这部分收入应当全额缴入国库。因此，选项A和D是符合条例规定的。

选项B和C不符合题意，因为题目明确指出是关于政府还贷公路的管理规定，而非经营性公路不涉及收费问题，财政专户虽然是一个资金账户，但题目强调的是未缴入国库的情况，所以这两个选项不是正确答案。

综上所述，正确答案是AD，因为它准确反映了《收费公路管理条例》中关于政府还贷公路通行费及转让权益收入管理的规定。