联合收割机运输车辆必须提有省级农机、交通部门和县级农机管理部门加盖公章的()且在有效期内才能判断合格。

本题考察的是对联合收割机运输车辆所需证件的理解。

首先，我们来分析各个选项：

A. 行驶证：行驶证是机动车辆的“身份证明”，由公安机关车辆管理机构发放，用于证明车辆的身份和行驶资格。但行驶证并不特定于联合收割机运输车辆，且题目中强调的是省级农机、交通部门和县级农机管理部门的公章，行驶证通常不由这些部门发放或管理，因此A选项不正确。

B. 驾驶证：驾驶证是驾驶员驾驶机动车辆的法定证件，由公安机关交通管理部门发放。它证明的是驾驶员的驾驶资格，而非车辆的身份或运输资格，因此B选项与题目要求不符。

C. 营运证：营运证是从事道路运输经营活动的车辆的合法凭证，由道路运输管理机构发放和管理。然而，联合收割机运输车辆通常不属于传统意义上的道路运输经营活动车辆，且题目中特别提到了省级农机、交通部门和县级农机管理部门的公章，这些部门通常不直接发放或管理营运证，因此C选项也不正确。

D. 作业证：对于联合收割机等农业机械，特别是需要跨区作业的机械，通常需要由相关部门（如省级农机、交通部门和县级农机管理部门）进行管理和审批。作业证是这些部门为了规范农业机械的跨区作业而发放的一种证明文件，上面加盖有相应部门的公章，并在有效期内有效。这完全符合题目中的描述，因此D选项是正确的。

综上所述，正确答案是D，即联合收割机运输车辆必须提有省级农机、交通部门和县级农机管理部门加盖公章的作业证，且在有效期内才能判断合格。